Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms