Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps50Q8CI71 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms