Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr47Q8CGF6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Wdr47Q8CGF6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr47Q8CGF6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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