Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rdh13Q8CEE7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rdh13Q8CEE7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh13Q8CEE7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh13Q8CEE7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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