Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc9Q8CDN9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms