Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo43Q8CDI2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms