Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms