Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms