Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc44a2Q8BY89 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms