Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp47Q8BY87 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms