Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms