Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Usp38Q8BW70 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Usp38Q8BW70 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Usp38Q8BW70 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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