Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp43Q8BUM9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp43Q8BUM9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp43Q8BUM9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp43Q8BUM9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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