Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms