Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc18a2Q8BRU6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms