Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efemp1Q8BPB5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms