Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms