Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms