Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prox2Q8BII1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms