Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn3Q8BHH8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms