Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms