Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms