Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necab1Q8BG18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms