Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfascQ810U3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms