Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NanogQ80Z64 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms