Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk9Q80W65 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms