Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NischQ80TM9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
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