Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpap1Q80TE0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap1Q80TE0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms