Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2q1Q7TSS2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms