Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShprhQ7TPQ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ShprhQ7TPQ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms