Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms