Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim12Q78RX3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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