Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rph3alQ768S4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms