Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynmQ70IV5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms