Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms