Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RfflQ6ZQM0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms