Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms