Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms