Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms