Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms