Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smchd1Q6P5D8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smchd1Q6P5D8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smchd1Q6P5D8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smchd1Q6P5D8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smchd1Q6P5D8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms