Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slx4Q6P1D7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms