Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HelbQ6NVF4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms