Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms