Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms