Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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