Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt39Q6IFX4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms