Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lemd2Q6DVA0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms