Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms