Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tpgs2Q66JT5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpgs2Q66JT5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms